Першы аналіз адсочвання Brucella abortus на аснове ўсяго геному ў правінцыі Чжэцзян - каманда біяінфарматыкі з Macro & Micro-Test уносіць свой уклад у сумесную публікацыю

—— Сумеснае даследаванне, праведзенае Цэнтрамі па кантролі і прафілактыцы захворванняў Чжэцзяна, Macro & Micro-Test і Цэнтрамі па кантролі і прафілактыцы захворванняў Кітая, апублікаванае ў часопісе Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

Агляд даследавання

У маі 2026 года ў часопісе Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) была апублікавана праца, падрыхтаваная пад кіраўніцтвам Цэнтра па кантролі і прафілактыцы захворванняў правінцыі Чжэцзян (Zhejiang CDC), у суаўтарстве з камандай біяінфарматыкаў з Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. і Нацыянальнага інстытута па кантролі і прафілактыцы інфекцыйных захворванняў (China CDC). Даследаванне мае назву:
«Ідэнтыфікацыя і філагенетычны аналіз сямі штамаў Brucella abortus у правінцыі Чжэцзян, Кітай».
Выкідак бруцэлы

Гэта даследаванне ўяўляе сабой першы сістэматычны філагенетычны аналіз прасочвальнасці Brucella abortus (B. abortus) на аснове ўсяго геному ў правінцыі Чжэцзян, Кітай. Каманда даследчыкаў прааналізавала сем ізалятаў, сабраных з 2015 па 2025 год (чатыры штамы чалавечага паходжання і тры штамы бычынага паходжання з Цзіньхуа, Цюйчжоу і Нінбо). Вынікі даследавання даюць геномныя доказы паходжання і шляхоў перадачы гэтага «паўночнага дамінантнага віду» ў нетыповым паўднёвым эпідэмічным рэгіёне ўсходняга Кітая.

 

Перадгісторыя і значэнне

 

Бруцэлёз — гэта зоанознае захворванне, якое выклікаецца бактэрыямі роду Brucella. Brucella abortus у асноўным заразляе буйную рагатую жывёлу, але можа выклікаць захворванні і ў людзей. У Кітаі бруцэлёз мае прыкметныя геаграфічныя адрозненні: найбольшая захворвальнасць назіраецца ў паўночных правінцыях (напрыклад, Унутраная Манголія, Шаньсі, Хэйлунцзян). Наадварот, у паўднёвых правінцыях, у тым ліку Чжэцзян, гістарычна дамінаваў Brucella melitensis, і было зарэгістравана вельмі мала выпадкаў заражэння B. abortus. Гэта рэгіянальнае адрозненне робіць генетычную характарыстыку і адсочванне крыніц B. abortus у Чжэцзяне ключавым прыярытэтам грамадскага здароўя.

 

Метады і асноўныя высновы

Даследчая група прыняла шматгранную стратэгію, якая спалучае малекулярную біялогію і біяінфарматыку:

1.Ідэнтыфікацыя патагена і базавая тыпізацыя

ПЦР гена BCSP-31 і AMOS-ПЦР пацвердзілі, што ўсе сем ізалятаў былі B. abortus.

Мультылокуснае паслядоўнае тыпізаванне (MLST) на аснове дзевяці хатніх генаў паказала, што ўсе ізаляты належалі да тыпу паслядоўнасці ST2, што сведчыць аб высокай генетычнай аднастайнасці сярод цыркулюючых штамаў B. abortus у правінцыі Чжэцзян.
Ідэнтыфікацыя патагена і базавая тыпізацыя

2.Характарыстыка ўсяго геному

Поўнаганамнае секвенаванне было праведзена на платформе Illumina NovaSeq. Аналіз сярэдняй нуклеатыднай ідэнтычнасці (ANI) паказаў, што ізаляты з Чжэцзяна мелі да 99,99% падабенства з эталонным штамам B. abortus 544.

Пангеномны аналіз выявіў высокакансерватыўную папуляцыю: было выяўлена 3084 асноўныя гены, а таксама толькі 10 генаў абалонкі, і не было выяўлена ніводнага гена мяккага ядра або воблака.

图片1

 

3.Профілі генаў вірулентнасці і антымікробнай рэзістэнтнасці

Усяго было прагназавана 68 фактараў, звязаных з вірулентнасцю, якія ахопліваюць класічныя шляхі, такія як біясінтэз ЛПС, сістэма сакрэцыі T4SS і двухкампанентная рэгуляторная сістэма BvrR-BvrS. Прыкметна, што ва ўсіх ізалятах адсутнічалі гены адгезіну bmaA і btaF. Аналіз генаў рэзістэнтнасці выявіў толькі ген mprF у базе дадзеных CARD, без выяўлення іншых дэтэрмінант рэзістэнтнасці.

Вірулентнасць4. Філагенетычная рэканструкцыя і адсочванне перадачы

Аналіз аднануклеатыднага палімарфізму ядра геному (cgSNP) размясціў ізаляты з Чжэцзяна на пэўнай пазіцыі ў глабальным філагенетычным дрэве. Вынікі паказалі, што штамы з Чжэцзяна ўтвараюць монафілетычную групу разам са штамамі з Расіі, Манголіі і некалькіх паўночных кітайскіх правінцый (Нінся, Хэйлунцзян, Унутраная Манголія, Хэбэй, Ганьсу, Пекін). Гэтая група далей падзяляецца на тры асобныя падклады (клады 1–3), што сведчыць аб некалькіх незалежных падзеях інтрадукцыі.

Філагенетычная рэканструкцыя

Высновы і наступствы

 

Гэта даследаванне прадстаўляе першы высокадакладны набор геномных дадзеных B. abortus у правінцыі Чжэцзян і прыводзіць да некалькіх ключавых высноў:

 

  1. Клеar генетычны фон– Штамы B. abortus, якія цыркулююць у правінцыі Чжэцзян, адносяцца да ST2, маюць высокую геномную кансерватыўнасць і ўяўляюць сабой тыповую лінію бруцэлёзу буйной рагатай жывёлы.

 

2. Эвішчыльнасць міжрэгіянальнай перадачы– Філагенетычны аналіз не пацвярджае існаванне незалежнай эндэмічнай лініі ў Чжэцзяне. Замест гэтага дадзеныя пераканаўча сведчаць аб тым, што гэтыя штамы паходзяць з паўночнага Кітая і могуць мець агульны эвалюцыйны фон са штамамі з Расіі і Манголіі. Наяўнасць трох падкладаў сведчыць аб некалькіх асобных падзеях інтрадукцыі.

 

3. Наступствы для грамадскага здароўя– Вынікі даследавання падкрэсліваюць важнасць геномнага назірання за бруцэлёзам нават у традыцыйна неэндэмічных рэгіёнах, такіх як Чжэцзян. Нягледзячы на ​​тое, што ў цяперашні час колькасць выпадкаў невялікая, інструменты высокай дакладнасці, такія як cgSNP, могуць эфектыўна адсочваць крыніцу завезеных успышак і даць навуковыя доказы для перапынення ланцужкоў перадачы, звязаных з міжправінцыйнымі перавозкамі жывёлы.

 

Гэтая праца не толькі запаўняе прабел у даследаваннях правінцыі Чжэцзян, але і дае новыя базавыя дадзеныя для маніторынгу патагенаў і ацэнкі рызыкі бруцэлёзу ў рэгіёне дэльты ракі Янцзы.

 

Інфармацыя пра дакумент:
Ян, Ю., Шы, Х., Чэнь, Дж., Ван, Л., Ву, З., Яо, У., … і Ву, Б. (2026). Ідэнтыфікацыя і філагенетычны аналіз сямі штамаў Brucella abortus у Чжэцзяне, Кітай. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 16, 1758965.

 

 


Час публікацыі: 10 чэрвеня 2026 г.