Нядаўняе метагеномнае даследаванне выявіла надзвычай разнастайны спектр вірусаў і бактэрый, якія пераносяцца грызунамі ў правінцыі Хэйлунцзян, у тым ліку вірус Ласа, вірус Амура, сальманелу і Yersinia pestis.
У даследаванні выкарыстоўвалісяНабор для ўзбагачэння РНК патагенаў ад Macro & Micro-Test, заснаваны на тэхналогіі захопу зондаў. Шляхам селектыўнага выдалення рРНК гаспадара і іншых кансерватыўных фрагментаў гаспадара, метад эфектыўна захоўваў мікробную РНК, значна паляпшаючы адчувальнасць выяўлення патагенаў. Гэты этап узбагачэння РНК патагенаў меў вырашальнае значэнне для дасягнення высокага ўзроўню выяўлення і забяспечыў моцную тэхнічную падтрымку для назірання за патагенамі.
Грызуны: асноўныя рэзервуары зоанозных захворванняў
Грызуны — самая багатая відамі і шырока распаўсюджаная група млекакормячых, якая налічвае больш за 2000 відаў па ўсім свеце і складае больш за 40% усіх відаў млекакормячых.
Акрамя экалагічнай значнасці, грызуны служаць асноўнымі рэзервуарамі і пераносчыкамі шматлікіх зоанозных патагенаў.Паколькі асяроддзе пражывання грызуноў часта перасякаецца з асяроддзем пражывання чалавека — праз прамыя ўкусы, кантакт з экскрэментамі або ўскосную перадачу праз блох і кляшчоў, — патагены, якія яны ўтрымліваюць, уяўляюць сабой пастаянную пагрозу для здароўя насельніцтва.
Варта адзначыць, што больш за 70% новых інфекцыйных захворванняў паходзяць ад дзікіх жывёл, прычым грызуны з'яўляюцца адным з найбольш значных рэзервуараў віруса.
Памежны рэгіён Хэйлунцзян: перадавая лінія назірання за патагенамі
Хэйлунцзян, памежная правінцыя на паўночным усходзе Кітая, валодае багатымі экалагічнымі рэсурсамі і мяжуе з некалькімі краінамі. Спалучэнне багатай біяразнастайнасці і частага перамяшчэння насельніцтва праз мяжу стварае спрыяльныя ўмовы для перадачы патагенаў.
У перыяд з чэрвеня па ліпень 2021 года даследчыкі сабралі 67 дзікіх грызуноў з горада Хэндаохэзі, горад Муданьцзян. Узоры ўключалі:
л 20паўвостраў Ападэм
л 47Myodes rufocanus
Усе асобнікі былі адлоўлены ў жылых раёнах і навакольных сельскагаспадарчых угоддзях, што сведчыць пра цесную сувязь паміж населенымі пунктамі і месцамі пражывання дзікіх жывёл.
Тэхналогія ўзбагачэння патагенаў: пераадоленне фонавых перашкод гаспадара
Пры метагеномным секвенаванні РНК гаспадара звычайна дамінуе ў счытваннях секвенавання, маскіруючы сігналы нізкай колькасці патагенаў.
Каб вырашыць гэтую праблему, у даследаванні выкарыстоўвалісяНабор для выяўлення метагеномных патагенаў ад Macro & Micro-Test. Выкарыстоўваючы тэхналогію захопу зондаў, спецыяльна распрацаваныя зонды звязваюцца з рРНК гаспадара і кансерватыўнымі паслядоўнасцямі, што дазваляе іх знясіленне і тым самым узбагачэнне мікробнай РНК.
Гэты падыход істотна палепшыў адчувальнасць выяўлення патагенаў, што дазволіла пры далейшым секвенаванні атрымаць большую долю паказанняў патагенаў. Этап узбагачэння заклаў трывалую аснову для дакладнай характарыстыкі спектру патагенаў, якія пераносяцца грызунамі.
Пасля ўзбагачэння ўзоры РНК падвергліся зваротнай транскрыпцыі, канструяванню бібліятэк і высокапрадукцыйнаму секвенаванню. Біяінфарматычны аналіз уключаў:
Фільтрацыя геному гаспадара
Таксанамічная класіфікацыя з выкарыстаннем Kraken2
Карэкцыя колькасці з дапамогай папараці
Гэты працоўны працэс стварыў поўны профіль вірусных і бактэрыяльных супольнасцей.
Вынікі даследавання: сумесная цыркуляцыя некалькіх вірусаў і бактэрый
Вынікі вірусных даследаванняў
Выяўленыя вірусы належалі да 21 віруснага сямейства, у тым лікуАрэнавірусыіГантавірусы.
Праздэ-новаЗ дапамогай зборкі з выкарыстаннем Megahit было створана 154 вірусныя кантыгі, з якіх 110 адпавядалі 19 вірусам з васьмі сямействаў.
In паўвостраў Ападэм, былі выяўленыя наступныя вірусы:
l Арэнавірусы: вірус Ласса, вірус Вэньчжоу, вірус Гайро
l Хантавірусы: вірус Амура, вірус Пуумала
In Myodes rufocanusБылі выяўлены артэрывірус пацукоў і вірус Амура.
Сярод гэтых патагенаў:
Вірус Ласа з'яўляецца ўзбуджальнікам віруснай гемарагічнай ліхаманкі, смяротнасць ад якой дасягае прыблізна 20%.
Амурскі вірус з'яўляецца адным з узбуджальнікаў гемарагічнай ліхаманкі з нырачным сіндромам (ГЛНС). Кітай мае найбольшую колькасць выпадкаў хантавірусных інфекцый у свеце.
Бактэрыяльныя вынікі
Усяго было анатавана 1051 бактэрыяльны род.
Найбольш распаўсюджанымі родамі былі:
лСальманела(26–31%)
лЕрсінія(11–23%)
Сальманелаз'яўляецца асноўным харчовым патагенам, які штогод з'яўляецца прычынай каля 9 мільёнаў выпадкаў брушнога тыфу і прыблізна 110 000 смерцяў ва ўсім свеце.
Yersinia pestis, узбуджальнік чумы, стаў прычынай трох гістарычных пандэмій. Правінцыя Хэйлунцзян прызнана адным з прыродных ачагоў чумы ў Кітаі і застаецца прыярытэтным рэгіёнам для маніторынгу чумы.
Значнасць даследавання
Навуковы ўнёсак
Гэта даследаванне ўяўляе сабой першае паведамленне аб фрагментах віруса Ласа і вірусе артэрыіту пацукоў у грызуноў з правінцыі Хэйлунцзян, пашыраючы базу дадзеных патагенаў, якія пераносяцца грызунамі, у Кітаі.
Ён сістэматычна характарызуе вірусныя і бактэрыяльныя супольнасці ў мясцовых папуляцыях грызуноў, забяспечваючы базавыя дадзеныя для назірання за зоанознымі захворваннямі ў памежных рэгіёнах.
Наступствы для грамадскага здароўя
Вынікі даследавання падкрэсліваюць неабходнасць пастаяннага назірання і скрынінгу патагенаўА. паўвостраваіМ. руфаканус.
Гэтыя дадзеныя даюць навуковыя доказы, якія пацвярджаюць стратэгіі кантролю крыніц такіх захворванняў, як чума і гемарагічная ліхаманка з нырачным сіндромам.
Метадалагічныя моцныя бакі
Метагеномнае секвенаванне дазваляе аб'ектыўна выяўляць як вядомыя, так і новыя патагены.
У гэтым даследаванні тэхналогія ўзбагачэння патагенаў кампаніі Macro & Micro-Test прадэманстравала высокую прадукцыйнасць, эфектыўна паляпшаючы выяўленне мэтавых патагенаў у складаных біялагічных узорах. Вынікі пацвярджаюць яе здольнасць падтрымліваць высокаадчувальную ідэнтыфікацыю патагенаў пры назіранні за дзікай прыродай.
Рэкамендацыя па прадукце
Зыходзячы з паспяховага прымянення ў гэтым даследаванні, набор для ўзбагачэння РНК патагенаў Macro & Micro-Test вельмі рэкамендуецца для даследаванняў метагеномнага назірання.
Дзякуючы эфектыўнаму знясіленню нуклеінавых кіслот гаспадара і ўзбагачэнню мікробных паслядоўнасцей, набор значна паляпшае адчувальнасць выяўлення і якасць дадзеных. Ён з'яўляецца важным інструментам для дакладнага выяўлення патагенаў у складаных узорах і забяспечвае надзейную тэхнічную падтрымку для назірання за станам грамадскага здароўя, ацэнкі рызыкі зоанозаў і падрыхтоўкі да ўспышак.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Час публікацыі: 02 сакавіка 2026 г.